Pada undian di kantor AFC, Indonesia berada di pot 1 bersama Hong Kong, Taiwan, Maladewa, Yaman, Afghanistan, Singapura, Myanmar, dan Kamboja.
Pada fase berikutnya, sepuluh pemenang babak pertama akan melaju ke babak kedua untuk bergabung dengan 26 tim yang lolos otomatis. Total sebanyak 36 tim akan dibagi dalam sembilan grup, yang masing-masing terdiri dari empat tim.
Selanjutnya 18 tim yang terdiri dari para juara grup dan tim peringkat kedua akan lolos ke putaran ketiga. Pada fase ini, tim-tim yang lolos akan dibagi dalam tiga grup berisi enam tim untuk memainkan pertandingan kandang-tandang menggunakan format round robin.
Pada babak keempat, enam tim yang lolos ke babak tersebut akan dibagi ke dalam dua grup yang masing-masing dihuni oleh tiga tim. Para juara grup akan otomatis lolos ke putaran final Piala Dunia 2026.
Sedangkan untuk para tim peringkat kedua, mereka akan melakoni babak kelima kualifikasi melawan negara-negara dari konfederasi lain dalam playoff.